为了把排风管道对平面布局的影响降到。常见的做法是，洁净区内排风竖管会设计于夹墙之内，后由技术夹层内横管转接排于室外，这一做法要求在平面布局时充分考虑预留夹墙位置及面积。
而在送风管道方面，仅有送风口需要采用防爆型，其他方面与非防爆区大体一致，见做法是直接由技术夹层内横管连接安装于吊顶之内的带有过滤器的防爆送风口以达到送风的目的。
由于洁净厂房生产环境的特殊性，通常状况下防爆区与非防爆区在连通时，无法使用在外墙上开门，利用走廊或阳台联系两个区域的方式。这时门斗作为规范强制要求，连接防爆区与非防爆区，在设置时注意门斗的两个门应当错开设置。
在洁净等级较低的洁净区，可适当的扩大门斗，从而使得人流、物流在均从门斗穿行的情况下，使相互影响降到。虽然在洁净厂房设计时“人流、物流不交叉”在各大规范法规中出现频率不低，但绝非人流、物流完全不能交叉。