商业保函的取得较为容易，费用也较低，但由于其本质为商业信用担保，所以公信力较低。另外，公司保函大多有很强烈的地域特色，某一地区被承认的担保公司多是由当地相关部门如建委等批准，因而其出据的保函也只在本地区内被承认。
由于保函一般都是无条件不可撤销的保函，因此，一旦受益人认为被保证人履约有瑕疵，受益人只需要向担保机构写封信就可以要求保证人支付相关担保资金，而保证人不能提出任何附加条件，之后，保证人可以向被保证人索赔该资金，因此一旦出具保函而被受益人索赔，而被保证人又无力支付相关资金，保证人将有很大的风险。而且，有时会碰到一些恶意套取保函资金的公司。因此担保方对保函条款的风险审查和被保证人的信誉调查等都要非常重视。
银行保函的特点：
1、保函依据商务合同开出，但又不依附于商务合同，具有独立法律效力。当受益人在保函项下合理索赔时，担保银行就必须承担付款责任，而不论委托人是否同意付款，也不管合同履行的实际事实。即保函是独立的承诺并且基本上是单证化的交易业务。
2、以银行信用作为保证，易于为合同双方接受。银行保函业务中涉及到的主要当事人有三个：委托人、受益人和担保银行，此外，往往还有反担保人、通知行及保兑行等。
农民工工资保函的必要性：
为什么以前很讲信用的人进了工地就成了骗子？没进工地之前总觉得自己很讲信用，进了工地才知道，你平时就算再讲信用，遇到工程款下不来，你又不能及时垫上时，工人一般只看钱不看人，你就算再好的信用逐渐也成了骗子，农民工工资保函就很有必要了。它不仅仅缓解企业财务压力，还保障农民工工资的如期、足额、按时发放。