预付款保函除在国际工程承包项目中使用外，也适用于货物进出口、劳务合作和技术贸易等业务。例如，在成套设备及大型交通工具的合同中，通常采用带有预付性质的分期付款或延期付款支付部分价款。在这种交易中，进口人在签订合同后，向出口人开立履约保证书，由银行保证进口人按合同规定按期支付价款，同时，出口人也向对方开立还款保证书。如出口人不能按期交货，银行保证及时偿还进口人已付款项的本金及所产生的利息。
如出口人不能按期交货，银行保证及时偿还进口人已付款项的本金及所产生的利息。 预付款保函是指银行对承包人进行担保的一种方式，银行开出符合业务要求的预付款保函后，承包人收到预付款，但并未按照合同执行项条款，未按时供货或者施工，业主这时提供相关证据，可向银行提起索赔，银行有见索即付的义务。承包人自己可以在银行开付余款保函，看承包人在银行的授信如何，授信好的保证金比例比较低，授信不好的保证金比例比较高，甚至是全额保证金。
预付款保函与履约款保函的区别
1、履约保函：
由担保人为施工方(申请人)向业主(受益人)提供的，保证施工方履行工程建设合同责任和义务，承包商不履行合同的，业主可要求保证人在保函金额内承担保证责任。保证人在承担保证责任后，可依法向承包商追偿。履约保函也可以适用于分包合同、材料设备供货合同的履行。一般是在签订合同时要做的事。简而言之是为了防止施工单位或供货商不按合同约定履行义务。担保的时间往往要贯穿整个项目，比较长。
2、预付款保函：
预付款保证担保是指由保证人为施工方向业主提供的，保证人对施工方履行扣还预付款义务的保证。以防止施工方在收到业主的预付款后将款项挪作他用或宣布破产等。当施工方在规定的时间内还清预付款项后，业主就需退还预付款保函。一般是在业主拿出预付款的时间段需要做的事，其实为了防止施工单位或供货商拿了预付款就跑路的事情发生。担保的时间往往不长，一般30-90天。
两者的适用范围都非常广泛，政府采招项目，大型房地产公司的招标项目，铁路物资招标项目、南方电网、国家电网的招标项目、中国移动、联通等都会明确要求必须提供此类保函，以保证项目的规范性。 广义上履约保函包括了履约保函、预付款保函、质量保修保函等，预付款保函其实是一种特殊形式的履约保函。 有时候一个项目中只要求提供一个履约保函。而不需要预付款保函，因为有的项目就没有预付款，有时候会要求履约、预付款保函同时开具，具体情况须当以实际项目而定。
从预付款保函和履约保函的定义中可以得出，不管是预付款保函还是履约款保函二者的终目的是一样的，都是为了程度的保护业主的权益。预付款保函和履约保函的区别主要在于担保的期限时间长短不同，前者较长而后者一般较短，现实中有的可能指存在其中的一个，这是大家视具体情况作出选择，学会灵活的运用。