三格式化粪池是由三个相互连通的密封粪池组成，粪便由进粪管进入池依此顺流至第三池，其各池的主要原理：
池
主要截留含虫卵较多的粪便，粪便经发酵分解，松散的粪块因发酵膨胀而浮升，比重大的下沉，因而形成上浮的粪皮、中层的粪液和下沉的粪渣。利用寄生虫的比重大于粪尿混合液的原理使其自然沉降于化粪池底部。利用粪液的浸泡和翻动化解粪块使其液化并截留粪渣于池底。厌氧发酵：化粪池的密闭厌氧环境，可以分解蛋白性有机物，并产生氨等物质，这些物质具有杀灭寄生虫卵及病菌的作用。
第二池
起进一步发酵、沉淀作用，与池相比，第二池的粪皮和粪渣的数量减少，因此发酵分解的程度较低，由于没有新粪便的进入，粪液处于比较静止状态，这有利于漂浮在粪池中的虫卵继续下沉。
第三池
主要起储存粪液的作用。经前二格处理的粪液进入第三池，基本上已经不含寄生虫卵和病原微生物，达到了粪便无害化要求，可以供农田直接施肥。
过粪管安装的位置关系到粪便流动方向，流程长短，是否有利于厌氧和能否有效阻流粪皮、粪渣、以及保持一、二池的有效容积，新鲜粪便进入粪池后，多集中在上层形成粪皮，然后逐渐疏松崩解，比重较大的下沉形成粪渣，粪皮与粪渣之间为稀粪液。寄生虫卵一般都集中在粪皮和粪渣中，因此，过粪管位置要放在寄生虫卵较少的中层粪液。过粪管位置较好的设置应分别斜插安装在两堵隔墙上：其中池到第二池过粪管下端位置在池的下1/3处，上端在第二池距池顶100mm左右：第二池到第三池过粪管下端位置在第二池的下端1/3或中部1/2处、上端在第三池距池顶100左右，过粪管与隔墙的水平夹角应呈60度。
化粪池维护管理
（一）新池建成确认无渗漏，并养护两周后正式启用。
（二）使用中要控制用水量。
（三）应按照设计周期清理粪皮和粪渣，在粪池内取出的粪渣须经堆肥法或化学法处理后再作肥料，第三池取出的粪水可直接用作肥料。
（四）保持化粪池盖板的密封性，在清渣或取粪水时，不得在池边点灯、吸烟等，以防发酵产生的沼气遇火爆炸。
清理化粪池注意事项：1、进化粪池的人得带好防毒面具和防毒服，还有得带好带，带上要捆上一根能够承重100公斤以上的绳子，绳子的另一头捆在露在化粪池外的梯子上。
2、化粪池上面得有两到三个人随时注意化粪池里面的情况，要是下面情况不对的地方就把清掏化粪池的工作人员给拉上来。
3、化粪池一般有三个井盖，每个井盖上都有两个小洞，我们得把每个井盖上的小洞打开后在隔半个小时或者一个小时。
4、再用铁钩把井盖打开，打开后在用消防水往每个井口里冲洗半个小时左右。这样能使化粪池里的沼气减少很多。
5、再用一根长度为5米左右的竹竿往化粪池里插，得到化粪池里的污物和污水的深度。
6、若是化粪池里的深度超过1.5米，我们就得用比化粪池还深1米左右的竹梯或者其它梯子放到化粪池里。