CT的工作程序涉及以下几个关键步骤：首先，根据人体不同组织对X线的吸收和透过率的不同，使用高灵敏度仪器对人体进行测量。测量所获取的数据随后被输入到电子计算机中进行处理，终生成人体被检查部位的断面或立体图像，从而能够发现体内检测部位的细小病变。
CT值（Hounsfield Unit, HU）：CT值是衡量物质密度的指标，定义为某物质的线性衰减系数与水的线性衰减系数之差，再除以水的线性衰减系数，然后乘以分度因子。当分度因子取值为1000时，CT值的单位为亨氏单位（Hounsfield Units，HU）。不同组织具有不同的线性衰减系数，因此CT值也各不相同。例如，骨组织对X射线的吸收能力强，因此其CT值较高，而气体对X射线的吸收能力弱，因而其CT值较低。水的CT值定义为0 HU，作为衡量其他物质密度的参照标准。
脱落细胞学检查常用的有阴道分泌物涂片检查子宫颈癌，痰涂片检查肺癌，胸、腹水离心后作涂片检查胸腔或腹腔的原发或转移癌和尿液离心后涂片检查泌尿道肿瘤等。我国医务工作者研制成食管细胞采取器（食管拉网法）检查食管癌及贲门癌（阳性确诊率为87.3%～94.2%）。还用鼻咽乳胶球细胞涂片、负压吸引细胞法及泡沫塑料海绵涂片法等采取鼻咽分泌物检查鼻咽癌，提高了阳性诊断率（阳性率为88%～92%）。用胃加压冲洗法采取胃内容物检查胃癌，也使阳性诊断率有了显著的提高。
活体组织检查 从患者身体的病变部位取出小块组织（根据不同情况可采用钳取、切除或穿刺吸取等方法）或手术切除标本制成病理切片，观察细胞和组织的形态结构变化，以确定病变性质，作出病理诊断，称为活体组织检查（biopsy），简称活检。这是诊断肿瘤常用的而且较为准确的方法。近年来由于各种内窥镜（如纤维胃镜、纤维结肠镜、纤维支气管镜等）和影像诊断技术的不断改进，不但可以直接观察某些内肿瘤的外观形态，还可在其指引下准确地取材，进一步提高了早期诊断的阳性率。